ОРВИ - комплекс (вирусы гриппа А и В, респираторно-синцитиальный вирус, вирусы парагриппа 1-4 типов, риновирус, аденовирус, метапневмовирус, коронавирус SARS-CoV-2, коронавирусы HKU1, NL63, OC43, 229E, бокавирус)

Метод определения: Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.
Исследуемый биоматериал: Соскоб из полости носа, Соскоб из полости ротоглотки.

Профиль объединяет этиологическую диагностику острых респираторных вирусных инфекций: в материале выявляется генетический материал возбудителей, которые чаще прочих поражают верхние и нижние дыхательные пути. Такое выявление нуклеиновых кислот служит дифференциальной диагностике вирусных инфекций дыхательных путей. Определяемые показатели:

1. Вирус гриппа А
2. Вирус гриппа В
3. Респираторно-синцитиальный вирус
4. Вирус парагриппа 1 типа
5. Вирус парагриппа 2 типа
6. Вирус парагриппа 3 типа
7. Вирус парагриппа 4 типа
8. Риновирус
9. Аденовирус
10. Метапневмовирус
11. Коронавирус SARS-CoV-2
12. Коронавирус HKU1
13. Коронавирус NL63
14. Коронавирус OC43
15. Коронавирус 229E
16. Бокавирус

ОРВИ составляют обширную группу острых инфекционных заболеваний, вызываемых вирусами с поражением слизистой оболочки дыхательных путей. Кашель, насморк и боль в горле обусловлены воспалением в верхних и нижних отделах дыхательных путей; заболевание сопровождается подъёмом температуры, интоксикацией и слабостью, иногда тошнотой и рвотой. Длится болезнь обычно не дольше недели, однако при отсутствии адекватного лечения присоединяются бактериальные инфекции, утяжеляющие течение и удлиняющие его. Возбудители относятся к четырём семействам РНК-содержащих вирусов – ортомиксовирусам, представленным вирусом гриппа, парамиксовирусам с респираторно-синцитиальным вирусом, метапневмовирусом человека и вирусами парагриппа 1-4, а также коронавирусам и пикорнавирусам, куда входят риновирусы; из ДНК-содержащих в комплекс включены аденовирусы видов B, C, E и парвовирусы, представленные бокавирусом человека.

Вирусы гриппа принадлежат семейству Orthomyxoviridae с тремя родами: Influenza A virus, Influenza B virus и Influenza C virus. Типы А и В ежегодно вызывают эпидемии разной интенсивности практически во всех странах мира, а тип А широко распространён в природе и выделяется у большинства зверей и птиц, отчего обладает высоким пандемическим потенциалом и преодолевает межвидовой барьер. Инкубационный период составляет от 1 до 4 суток, в среднем около 48 часов. Типичная картина у взрослых начинается внезапно: озноб, лихорадка, прострация, кашель, генерализованные боли с преимущественной локализацией в спине и ногах, сильная головная боль, нередко со светобоязнью. Большинство заболевших переносит грипп без осложнений, но возможны тяжёлое течение и жизнеугрожающие состояния, прежде всего у детей раннего возраста, пожилых, беременных и родильниц, лиц с хронической лёгочной и сердечной патологией, метаболическими нарушениями, дефектами иммунитета, неврологическими и когнитивными расстройствами.

Респираторно-синцитиальный вирус во всём мире служит основной причиной бронхиолита и пневмонии у детей младшего возраста и младенцев; он достаточно устойчив во внешней среде. В группу риска тяжёлого течения входят недоношенные, дети до двух лет, лица с ослабленным вследствие болезни либо лечения иммунитетом и пожилые старше 65 лет. Метапневмовирус стоит на втором месте после РС-вируса среди причин острого бронхиолита на первом году жизни, а также вызывает пневмонию и бронхиальную астму. Вирусами парагриппа к двум годам хотя бы однократно переболевает каждый ребёнок: типы 2 и 4 чаще выявляются на первом году жизни, тогда как в остальных возрастных группах преобладают типы 1 и 3. Аденовирусы подразделяют на семь видов, от A до G. Инфекция протекает остро: интоксикационный синдром умеренный, а симптоматика определяется видом вируса и включает поражение слизистых верхних дыхательных путей, лимфоидной ткани, глаз и кишечника. Известно бессимптомное носительство, когда возбудитель месяцами и годами сохраняется в лимфоидной ткани верхних отделов дыхательных путей. Риновирусы принадлежат к самым распространённым возбудителям ОРВИ у взрослых и детей всех возрастных групп: они воспаляют слизистую оболочку верхних дыхательных путей, инфекция проявляется насморком, кашлем и нередко осложняется трахеитом. Бокавирус обнаруживается преимущественно у младенцев и детей, часто в сочетании с другими возбудителями, и проявляется лихорадкой, кашлем, насморком, диареей.

Острую респираторную инфекцию у человека вызывают четыре распространённых в популяции коронавируса: 229E, OC43, NL63 и HKU1. Течение чаще лёгкое либо средней тяжести с поражением верхних дыхательных путей, реже вовлекаются нижние отделы; кишечная разновидность встречается значительно реже и преимущественно у детей. К тому же семейству относится опасный вирус SARS-CoV: в ряде случаев заболевание принимает форму атипичной пневмонии либо тяжёлого острого респираторного синдрома, а такая патология отличается высокой летальностью, поскольку сопровождается острой дыхательной недостаточностью. Появление новых типов коронавирусов связывают с высокой способностью этих вирусов к мутациям. Отдельным показателем комплекса определяется появившийся в декабре 2019 года штамм SARS-CoV-2, возбудитель инфекции COVID-19. У 80-85 % заболевших она протекает легко, но у части больных развиваются тяжёлая пневмония и респираторный дистресс-синдром.
Полимеразная цепная реакция остаётся наиболее эффективным методом: нуклеиновые кислоты вируса обнаруживаются в среднем до 7 дней и самое большее до двух недель от начала заболевания при сохранении признаков поражения верхних дыхательных путей. Преимущества метода: прямое указание на присутствие вируса по специфическому участку его РНК или ДНК; высокая специфичность, поскольку идентифицируется фрагмент, уникальный и характерный лишь для данного вируса; высокая чувствительность, позволяющая обнаружить возбудитель при чрезвычайно малой исходной концентрации. Выявление нуклеиновых кислот возбудителей применяется при дифференциальной диагностике вирусных инфекций дыхательных путей.